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牦牛MT—IV基因克隆与序列分析

杨联 张利平 王磊 王佳 吴建平 草业科学 2008年第10期

摘要:采用RT—PCR方法,利用特异性引物YMT-IVSP1和YMT-IVSP2先克隆出牦牛Bos grunniens MT—IV的编码区序列全长,将其与人MT—IV基因全序列比对,设计2对引物分别克隆内含子1和内含子2,将获得序列拼接后得到了牦牛MT—IV外显子与内含子全长为2099bp(GenBank Accession No.:EU665491),编码区序列长189bp,编码62个氨基酸,20个半胱氨酸残基,不含芳香族氨基酸,2个内含子的长度分别为1392和518bp。将牦牛MT—IV基因编码区序列和氨基酸序列BLAST搜索结果表明,MT—IV在物种间高度保守。牦牛MT—IV氨基酸序列与牛、绵羊、山羊、狗、家鼠、人和马的比对表明,MT—IV包含有金属硫蛋白(MTs)特有的C—X—C、C—C—X—C—C、C—X—X—C结构域,构建的系统发育树与比较生理学和形态学相同,表明牦牛MT—IV具有与其他哺乳动物相同的分子特性,有必要进行牦牛MT—IV在上皮细胞中表达量水平的研究。

关键词:牦牛基因克隆生物信息学分析

单位:甘肃农业大学动物科学技术学院 甘肃兰州730070

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