摘要:从NCBI中下载了202325条高粱Sorghum bicolor EST序列。去除低质量和冗余的序列后,在5661条高粱EST中共发掘出了6663个SSR位点,出现频率是20.19%,平均分布频率是1/3.93kb。在5197条EST序列中,共有3446条序列能够设计引物,占总数的66.3%。在高粱EST-SSR中,三核苷酸重复是主要的重复类型,出现最多的重复基元是GGC/GCC。在3446对高粱EST—SSR引物中,随机选择了20对引物进行了合成。以苏丹草Sorghum sudanense722和高梁Sorghum bicolor TX623A为模板,用这20对引物进行PCR扩增,结果全部可以扩增出条带,可用率为100%,有差异的有4对,多态性比率为20%。研究结果证明了根据高梁EST建立SSR标记是有效、可行的。
关键词:高粱 苏丹草
单位:安徽科技学院 安徽凤阳233100
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