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小叶锦鸡儿SSR-PCR体系优化及应用

韩永增 王赞 高洪文 草业科学 2011年第03期

摘要:为建立适宜小叶锦鸡儿(Caragana microphylla)SSR-PCR的反应体系,利用正交试验设计L16(45),对模板DNA、Mg2+、dNTP、引物和Taq DNA聚合酶的浓度进行五因素四水平优化筛选,确立最佳反应体系和扩增程序。即在25μL反应体系中包括:40 ng模板DNA,3 mmol/L Mg2+,300μmol/L dNTP,0.6μmol/L引物,1 UTaq DNA聚合酶,1×Buffer。扩增反应程序为:94℃10 min;94℃45 s,65℃1 min,72℃1 min,10个循环,每循环的复性温度递减1℃;94℃45 s,55℃1 min,72℃1 min,30个循环;72℃10 min,4℃保存。应用该优化体系对小叶锦鸡儿种质资源及不同引物进行了检验及筛选。本研究表明,该体系的建立为今后利用SSR标记对小叶锦鸡儿属遗传多样性研究、遗传图谱构建及种质资源鉴定等研究工作提供依据。

关键词:小叶锦鸡儿体系优化

单位:兰州大学草地农业科技学院 甘肃兰州730020 中国农业科学院北京畜牧兽医研究所 北京100193

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