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垂穗披碱草ISSR反应体系的正交优化

刘新亮 德英 赵来喜 草业科学 2011年第05期

摘要:以垂穗披碱草(Elymus nutans)基因组DNA为模板,对ISSR—PCR反应体系中5个因素(TaqDNA聚合酶、Mg^2+、模板DNA、dNTPs、引物)进行优化试验,建立垂穗披碱草稳定的ISSR—PCR反应体系及最佳扩增程序。在25μL反应体系中,最佳反应体系为2.5μL10×buffer(不合Mg^2+)、1.0UTaq酶、2.0mmol/LMg^2+、30~120ng模板DNA、0.25mmol/LdNTPs、0.25μmol/L引物。在优化体系的基础上筛选出11条多态性丰富,扩增稳定的引物,并通过设置退火温度梯度、循环次数梯度、延伸时间梯度,得到垂穗披碱草ISSR—PCR最佳扩增程序。反应程序:94℃预变性2min,94℃变性1min,51℃退火1min(视不同引物而定),72℃延伸1.5min,共41个循环,72℃延伸10min。通过对ISSR—PCR最佳反应体系和最佳扩增程序的验证,发现该反应体系和扩增程序具有较高的稳定性和较好的重复性。

关键词:垂穗披碱草正交优化

单位:中国农业科学院草原研究所 内蒙古呼和浩特010010 中国农业科学院研究生院 北京100081

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