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8 种柱花草属牧草 SSR-PCR 反应体系优化及引物筛选

张龙 丁西朋 严琳玲 胡珊娜 白昌军 草业科学 2014年第02期

摘要:柱花草(Stylosanthes)是优良的豆科牧草, 叶片中含有大量的多糖多酚, 本研究利用改良CTAB法抽提柱花草叶片中总DNA。通过正交试验设计L16(45), 确立了柱花草SSR-PCR最佳反应体系:20 μL体系中1 μL 50 ng·μL-1模板DNA, 1.6 μL 5 μmol·L^-1引物, 1.6 μL 10 mol·L^-1dNTPs, 1.2 μL 25 mol·L^-1 Mg^2+, 0.3 μL 5 U·μL-1Taq聚合酶, 2 μL 10×PCR Buffer(Mg^2+ free), 剩余用ddH2O补足。扩增反应程序为94 ℃变性40 s, Tm(不同退火温度)退火时间40 s, 72 ℃延伸45 s, 循环数35个。利用优化体系对来自7种柱花草的123对SSR引物在8个不同种柱花草中进行转移, 共筛选出44对引物在8种柱花草中都能有效扩增, 并从中筛选出26对在8个不同种柱花草中富含多态性引物, 为今后利用SSR标记对柱花草属的指纹图谱构建、遗传多样性分析、分子育种和品种鉴定与保护等工作提供重要依据。

关键词:柱花草改进ctab法体系优化引物筛选

单位:海南大学农学院 海南海口570228 中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所 海南儋州571737

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