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“兰箭3号”春箭筈豌豆叶绿体全基因组草图及特征分析

陶晓丽; 马利超; 聂斌; 王彦荣; 刘志鹏 草业科学 2017年第02期

摘要:箭筈豌豆(Vicia sativa)是自花授粉的二倍体一年生豆科牧草,可为我国高海拔地区的反刍动物提供优质蛋白粗饲料。以"兰箭3号"春箭筈豌豆为研究对象,采用DNase I法纯化叶绿体,利用第二代高通量测序平台Illumina Hiseq2000进行测序,并对"兰箭3号"叶绿体全基因组序列的结构特征进行分析。结果表明,"兰箭3号"叶绿体基因组仅包括一个单拷贝的反向重复序列,其叶绿体全基因组大小为121 883bp,共编码了109个基因,包括4个核糖体RNA(rRNA)基因,29个转运RNA(tRNA)基因,75个蛋白质编码基因和1个假基因。"兰箭3号"在叶绿体基因组结构、基因种类、排列顺序上与其它豆科植物基本一致。其叶绿体全基因组序列已在GenBank注册,序列号为KU053796。"兰箭3号"叶绿体全基因组测序的成功为叶绿体分子生物学研究奠定了基础,并可有效地促进箭筈豌豆遗传育种和分子进化研究。

关键词:箭筈豌豆叶绿体全基因组密码子偏好性进化分析

单位:草地农业生态系统国家重点实验室兰州大学草地农业科技学院; 甘肃兰州730020; 中国科学院青岛生物能源与过程研究所; 山东青岛266101

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