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紫花苜蓿bZIP基因家族的鉴定、进化及表达分析

齐晓; 张正社; 闵学阳; 孙启忠; 刘文献 草业科学 2017年第08期

摘要:碱性亮氨酸拉链(bZIP)转录因子是真核生物转录因子中分布最广泛、最保守的一类蛋白。目前在许多植物中已发现大量的bzIP转录因子,这些bzIP转录因子成员广泛参与种子贮藏基因的表达、植物的生长发育、光信号传导、病害防御、生物和非生物胁迫应答以及ABA的敏感性等各种信号的反应。本研究首次从紫花苜蓿(Medicago sativa)全转录组水平鉴定出bZIP转录因子家族共包含138个基因,根据bZIP蛋白序列进行系统进化分析可以将其分为10类;对Ms6zIP基因的系统进化分析表明该基因家族在分类上有很高的保守性。该转录因子家族的基因密码子偏好性分析表明,Ms6ZJP基因密码子偏好使用A/T碱基。此外,胍6ZIP基因GO功能注释分析结果显示,138个Ms6ZJP基因最终分为23个G0分类,总体包括分子功能和生物学过程两类。相关性分析结果表明,共有372对基因表达相关性极显著(P〈O.01)。本研究可为紫花苜蓿bZIP转录因子功能特性、进化历程和生物功能的深入研究奠定基础。

关键词:bzip转录因子紫花苜蓿系统进化分析密码子偏好性

单位:中国农业科学院草原研究所; 内蒙古呼和浩特010010; 全国畜牧总站全国草品种审定委员会办公室; 北京100125; 草地农业生态系统国家重点实验室兰州大学草地农业科技学院; 甘肃兰州730020

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