摘要:以巨菌草(Pennisetum giganteum sp.)内生细菌为试验材料,利用平板对峙法筛出对玉蜀黍平脐孺孢(Bipolarismaydis)具有较强拮抗作用的巨菌草内生菌,并采用Illumina Miseq PE150 对该菌株进行基因组测序、基因组分析、基因预测与功能注释、直系同源簇[COG]聚类分析等。结果表明,抗菌作用最强的内生菌JK7-2 为链霉菌(Streptomyces sp.),通过基因组测序分析,获得290 Conrigs,整个基因组大小约8.4 Mb,GC 含量为73.17%,序列已提交至NCBI 数据库SRA BioProject 获得登录号:PRJNA451251。同时,预测其编码7 432 个基因,并发现多个与链霉素、青霉素和四环素产生等代谢通路相关的基因。研究结果为深入研究巨菌草内生生防菌的抗菌机制以及挖掘生防菌次级代谢产物相关基因提供了理论依据。
关键词:巨菌草 内生链霉菌 玉蜀黍平脐蠕孢 拮抗 基因组测序分析
单位:福建农林大学生命科学学院; 福建福州350002; 国家菌草工程技术研究中心; 福建福州350002; 龙岩学院生命科学学院; 福建龙岩364012
注:因版权方要求,不能公开全文,如需全文,请咨询杂志社