摘要:布尔网络是研究基因调控网络的一种非常重要的模型,通过时序数据推理基因之间的调控关系是研究网络动态行为和干预策略的基础。现有的预测研究主要集中在基因之间的调控关系,而对调控基因与目标基因之间的布尔函数的作用方式研究甚少。由于基因调控网络是一种处于有序和无序之间的临界网络,本文研究了众数规则、基于偏斜和基于互信息的三种泛化方法对临界布尔网络的稳态分布距离和灵敏度误差的影响。结果表明合理的泛化能够明显提高预测网络的稳态分布距离和灵敏度误差指标。三种泛化方法中,基于互信息的泛化方法的总体性能最好。
关键词:基因调控网络 布尔网络 动态行为 泛化
单位:温州大学物理与电子信息工程学院 浙江温州325035 温州大学城市学院 浙江温州325035 西北工业大学计算机科学与技术学院 陕西西安710072
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