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湖泊沉积物中DNA提取与PCR扩增

申慧彦 李世杰 地球科学进展 2008年第04期

摘要:对湖泊沉积物中保存的生物大分子-DNA进行研究分析,以探讨湖泊生态系统随环境改变而演变的过程。根据前人对土壤和海洋沉积物DNA的提取方法,针对湖泊沉积物的特点进行改进,在此基础上对太湖梅梁湾湖泊沉积岩芯进行DNA提取和扩增。结果表明:不同深度湖泊沉积物均能获得DNA,且纯度较高,OD2加/OD280均大于1.4、OD260/OD230大于1.1,可直接用于PCR(polymerase chain reaction)扩增。对微囊藻的16SrRNA基因进行PCR扩增,结果发现在前5个沉积物样品中,均得到了200bp左右的微囊藻16SrRNA基因片段,表明微囊藻或已降解的微囊藻基因片段存在于这5个层位的湖泊沉积物中。这为利用湖泊沉积物中的生物分子来推断历史湖泊生物群落结构,判断湖泊生态演变的历史提供了新的研究思路。

关键词:湖泊沉积物微囊藻dna提取pcr扩增

单位:中国科学院南京地理与湖泊研究所湖泊与环境国家重点实验室 江苏南京210008 中国科学院研究生院 北京100039

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地球科学进展

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