摘要：为了明确甜叶菊EST序列中SSR的总体特点,开发甜叶菊EST-SSR分子标记,为利用EST-SSR标记开展甜叶菊分子遗传研究提供科学依据。本研究从NCBI数据库中下载获得了5 646条EST序列,利用在线软件SSRtool和Websat检测所含SSR位点进行分析。结果共检索出88个SSR位点序列,分布于79条EST序列中,检出率为1.6%。其中,六核苷酸重复基元的EST-SSR占主导地位,占总SSR数目的 63.7%。利用在线软件Primer 3.0设计了62对EST-SSR引物,经筛选验证获得了多态性较好的引物32对,表明通过甜叶菊EST序列开发SSR标记是可行的。

关键词：甜叶菊 ncbi 多态性 

单位：南昌师范学院; 生物技术研究所; 南昌330032