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E.coliK-12琥珀酸脱氢酶sdhC基因纳米锥的设计及自组装

周末; 刘彦君; 佟欣瑞; 董延甲; 吴欣瑜; 王迎香; 应明 化工进展 2020年第02期

摘要:采用DAEDALUS软件,以E.coliK-12MG1655的琥珀酸脱氢酶复合体C亚基编码酶基因sdhC的双链DNA为脚手架链,进行一个边长为17.68nm的正四面锥设计,并最终通过核酸自组装反应获得了sdhC基因的纳米锥聚合体。利用琼脂糖凝胶电泳、扫描电子显微镜和透射电子显微镜对多组样品进行化学组分和形貌分析,同时利用原子力显微镜液下成像法测定了核酸聚合体的三维尺度。结果表明:DAEDALUS软件设计出的16条订书钉链,确实将624bp的sdhC双链DNA中的一条链折叠成了平均边长为19.05nm的正四面锥,与预设模型仅相差1.37nm,证明普通基因的双链DNA可以替代M13mp18单链核酸作为DNA折纸的核酸材料,为构建核酸纳米材料提供了一种新方法。

关键词:dna折纸术纳米材料琥珀酸脱氢酶脱氧核糖核酸自组装

单位:天津理工大学化学化工学院; 天津300384; 天津理工大学计算机科学与工程学院; 天津300384

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化工进展

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