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猪伪狂犬病毒Guizhou-DY株gE基因的克隆及生物信息学分析

郝飞; 汤德元; 罗险峰; 曾智勇; 李春燕; 甘振磊; 王凤; 刘建; 王洪光 黑龙江畜牧兽医 2013年第08期

摘要:为了研究伪狂犬病毒gE蛋白的结构及其在免疫保护中的功能,试验根据GenBank中猪伪狂犬病毒(PRV)GDSH株(登录号为EF552427)gE全基因序列设计引物,对伪狂犬病病毒gE基因进行PCR扩增、克隆及生物信息学分析。结果表明:PCR扩增基因全长1 734 bp,编码577个氨基酸,与Yangsan株对应序列同源性为99.4%,测序结果已提交GenBank,登录号为JX417716;Guizhou-DY株gE蛋白是一种不稳定的疏水性蛋白,柔性区域呈散在性分布,以T转角和无规则卷曲为主,具有2个疏水区,在100~400位氨基酸残基处抗原性指标较高,基因序列保守性强;经预测,gE全基因不能在大肠杆菌表达系统中得到高效表达。

关键词:ge蛋白生物信息学分析

单位:贵州大学动物科学学院; 贵阳550025; 贵州省动物疫病预防控制中心; 贵阳550008

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