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大肠杆菌的同义密码子使用偏性对蛋白质折叠速率的影响

黄俏 李瑞芳 于志芬 内蒙古师范大学学报·教育科学版 2015年第04期

摘要:考虑到同义密码子使用偏性的物种差异性,选取大肠杆菌的54条核蛋白为研究对象,将每条核蛋白按二级结构截取出α螺旋片段、β折叠片段和无规卷曲(α-β混合)片段,然后找到每个片段相关的核酸序列信息,计算其同义密码子使用度和相应肽链的折叠速率。在此基础上,分析了同义密码子使用偏性和相应肽链折叠速率之间的相关性,发现对于不同二级结构类的肽链片段,都有部分密码子的使用偏性与其对应的肽链折叠速率显著相关。因此,在蛋白质折叠中,同义密码子的使用偏性起着重要作用。

关键词:大肠杆菌核蛋白同义密码子使用偏性蛋白质折叠速率

单位:内蒙古师范大学物理与电子信息学院 内蒙古呼和浩特010022

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