摘要:建立了一个包括回文结构特征等核苷酸信息的蛋白质折叠数据库,以数据库中每一个蛋白质为研究样本,计算了相应mRNA序列中回文结构的回文密度,分析了回文密度与蛋白质折叠速率之间的相关性.结果证实,对于所有蛋白质,回文密度与蛋白质折叠速率呈负相关;进一步研究发现,对蛋白质折叠进程真正起阻碍作用的是那些被几个回文结构重复使用的碱基,而且对于不同二级结构类蛋白质以及不同折叠类蛋白质,回文密度与蛋白质折叠速率的相关性有很大的差异.
关键词:mrna序列 蛋白质折叠速率 回文结构 回文密度
单位:内蒙古师范大学物理与电子信息学院; 内蒙古呼和浩特010022; 内蒙古自治区人民医院信息中心; 内蒙古呼和浩特010020
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