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冰菜盐胁迫下的转录组分析

练冬梅; 赖正锋; 姚运法; 林碧珍; 洪建基 热带亚热带植物学报 2019年第03期

摘要:为了解冰菜(Mesembryanthemum crystallinum)叶片抗盐相关基因组学,利用Illumina Hi-seq TM2500高通量测序技术研究冰菜叶片在400mmolL–1NaCl胁迫下转录组基因的差异表达。结果表明,从400mmolL^–1NaCl胁迫和对照的冰菜叶片中共获得13.01Gb Clean data,Q30碱基均大于90.08%。共获得123个差异表达基因(DEGs),包括73个上调基因,50个下调基因,其中功能注释的基因有96个。根据Unigene库序列进行GO、COG和KEGG注释,筛选出8个与抗盐性相关差异表达基因,植物激素代谢相关基因,脱落酸8'-羟基化酶、吲哚-3-乙酰酸酰胺合成酶和茉莉酮酸酯ZIM结构域蛋白基因均下调表达,生长素响应蛋白、细胞分裂素合酶基因则上调表达,糖代谢相关基因棉子糖合成酶基因上调表达,质膜H^+-ATPase基因上调表达,脱水蛋白基因下调表达。这为冰菜耐盐基因组学和分子生物学的研究奠定基础。

关键词:冰菜盐胁迫叶片转录组差异表达基因

单位:福建省农业科学院亚热带农业研究所; 福建漳州363005

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