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幽门螺杆菌HPAG1_1448基因生物信息学分析

毛福荣 张荣光 尹光辉 晋雪香 梁维 山东医药 2008年第29期

摘要:目的对幽门螺杆菌(HP)HPAG1_1148基因进行生物信息学分析,为HP疫苗和细菌学研究奠定基础。方法应用Omiga2.0等生物软件和Swiss—port、GenBank等数据库分析HPAG1_1148基因的变异性及其表达蛋白的化学性质、分子结构、保守区、抗原结构域、抗原表位。结果该基因同源性为93.7%-97.4%,表达蛋白N端有长约23aa的信号肽,为分泌型蛋白,具有抗原结构域、B细胞抗原表位及与胞膜孔道蛋白相似的保守区。结论该基因具有较高保守性,表达蛋白是一种分泌型外膜蛋白,可能具有转运功能和抗原分子结构特征,有望成为HP疫苗。

关键词:幽门螺杆菌生物信息外膜蛋白疫苗

单位:郑州大学基础医学院 河南郑州450052 郑州大学临床医学系

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