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直接测序法检测结肠癌K-ras基因的灵敏度确认及评估

张树鹏 赖仁胜 林路加 谢玲 杜益群 吴晓群 赵苏苏 山东医药 2011年第11期

摘要:目的探讨直接测序法检测K-ras基因的灵敏度及可行性。方法用已知K-ras基因突变型及野生型细胞株DNA按比例混合,用直接测序法检测K-ras基因突变情况,对实验敏感度进行评估。结果正反向测序结果均显示,含突变型K-ras基因DNA 5%的5个复孔中,均未能明确检出突变,而含突变型基因DNA≥10%的所有样本及其复孔都检测出了突变;突变型的基因碱基T峰与野生型的对应碱基G峰的比例,各组间有明显差异(P均〈0.05),且峰高随突变型DNA的质量浓度增加而增加,二者存在明确相关性(相关系数r=-1.00,相伴概率〈0.05)。结论直接测序法检测突变型DNA,当敏感度为10%时,特异性达到100%,且电泳图上突变峰与野生峰的高低比例可对细胞比例进行半定量评估,可以满足临床检测与研究。

关键词:肠肿瘤基因检测直接测序法灵敏度

单位:南京中医药大学 南京210029 南京中医药大学附属医院江苏省中医院 新加坡默克雪莱诺公司亚太区肿瘤临床开发部

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