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胰腺癌细胞DPYD、MTHFR基因单核苷酸多态性分析

张孝平 张文静 陈宝安 柏志斌 冯继峰 程璐 山东医药 2011年第45期

摘要:目的检测胰腺癌(PC)细胞株中两种代谢相关基因的单核苷酸多态性(SNPs),为临床预测氟尿嘧啶类药物的疗效及毒副反应提供参考依据。方法培养PANC-1、CFPAC、SW1990三株PC细胞,采用QIAamp DNABlood Minikit试剂盒提取基因组DNA,用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱技术行二氢嘧啶脱氢酶基因(DPYD)rs1801159、rs1801160、rs17376848,亚甲基四氢叶酸还原酶(MTHFR)基因rs2274976、rs1801131、rs1801133的SNPs位点检测。结果三种PC细胞株的DPYD基因rs1801159位点基因型均为A/A纯合子,rs1801160位点基因型均为G/G。CFPAC细胞株DPYD基因的rs17376848位点基因型为A/G,PANC-1、SW1990细胞株的rs17376848位点基因型为A/A纯合子。PANC-1、CFPAC细胞MTHFR基因的rs1801131位点基因型为A/C杂合子,rs1801133位点基因型为C/C;SW1990细胞株MTHFR基因的rs1801131位点基因型为A/A纯合子,rs1801133位点基因型为T/T纯合子;三株细胞MTHFR基因的rs2274976基因型位点均为G/G纯合子。结论本实验所测三株PC细胞的DPYD基因rs1801159、rs1801160位点、MTHFR基因rs2274976位点基因型相同,其余各位点基因型均不完全相同。

关键词:胰腺肿瘤单核苷酸多态性二氢嘧啶脱氢酶基因亚甲基四氢叶酸还原酶

单位:东南大学医学院附属中大医院 南京210009 东南大学医学院肿瘤系 江苏省肿瘤研究所 东南大学生物科学与医学工程学院生物电子学国家重点实验室

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