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用基因芯片技术筛选人子宫内膜癌细胞株中紫杉醇耐药相关基因

林凤 郑君 周友珍 山东医药 2015年第19期

摘要:目的应用基因芯片技术筛选人子宫内膜癌细胞株中获得性紫杉醇(TAX)耐药相关基因。方法采用大剂量间歇诱导法,用TAX反复冲击诱导培养人子宫内膜癌Ishikawa细胞株,建成Ishikawa/TAX耐药株。应用Affymetrix Human Genome U133 Plus2.0表达谱芯片检测Ishikawa/TAX与Ishikawa细胞株基因。通过Gene Ontology(GO)聚类分析对差异表达的基因予以分类。采用qRT-PCR对部分差异表达的基因进行验证。结果与Ishikawa细胞相比,Ishikawa/TAX细胞中有110条基因表达有显著性差异(ratio比值〉3),包括87个上调基因、23个下调基因,GO分类涉及细胞信号传导和调控、细胞黏附分子、细胞代谢及转录调控等;其中上调最明显的基因为S100A12,其次有CYP1B1、FUBP1、CEACAM6,下调基因有TNFAIP3、CD44、DKK1等。qRT-PCR检测S100A12、CYP1B1在耐药细胞中高表达,TNFAIP3、CD44在耐药细胞中低表达,与基因芯片结果一致。结论采用基因芯片技术筛选出的人子宫内膜癌获得性TAX耐药相关基因的上调基因有S100A12、CYP1B1、FUBP1、CEACAM6,下调基因有TNFAIP3、CD44、DKK1。

关键词:基因芯片技术子宫肿瘤子宫内膜癌紫杉醇耐药基因

单位:首都医科大学附属北京世纪坛医院 北京100038

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