摘要：套作是防治连作障碍的有效方法之一,但是蔬菜和可食用菌之间的套作机理研究鲜见报道,尤其是其土壤微生物学机制。本研究建立菇菜套作体系,利用实时荧光定量PCR和PCR-DGGE技术研究土壤细菌和真菌群落的变化。结果表明,菇菜套作显著提高了番茄生物量,且其番茄果实产量最高,硝酸盐含量最低。与对照相比,菇菜套作下土壤细菌和真菌基因拷贝数量均无显著变化;DGGE指纹图谱表明,不同处理下的细菌群落无明显差异,但是菇菜套作下真菌群落结构发生了分异,主要表现为尖孢镰刀菌（Fusarium oxysporum）和稻黑孢菌（Nigrospora oryzae）代表型条带的强度的下降。

关键词：菇菜套作 土壤微生物 实时荧光定量pcr 

单位：土壤与农业可持续发展国家重点实验室中国科学院南京土壤研究所 南京210008 南京土壤研究所-香港浸会大学土壤与环境联合开放实验室 南京210008 中国科学院大学 北京100049 南京中科院跨克科技有限责任公司 南京210008