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朗之万方程及其在蛋白质折叠动力学中的应用

蒋泽南 房超 孙立风 物理学报 2011年第06期

摘要:研究了朗之万方程的动力学性质,并用它模拟了蛋白质分子的折叠过程.首先在相空间中对朗之万方程做连续映射,发现做布朗运动的粒子在位置坐标上存在明显的概率分布,这表明蛋白质折叠过程中分子空间构型是非遍历的.此外,本文还通过数值模拟得到了去折叠态蛋白质的紧密度指标,并验证了它与实验结果以及其他理论方法的一致性.本文还提出了一种利用重整化方法研究熔球体状态蛋白质的理论模型,并提供了考虑疏水基影响的蛋白质折叠过程的模拟思路.

关键词:朗之万方程蛋白质折叠非遍历性紧密度指标重整化

单位:西门菲莎大学物理系 本拿比V5A1S6 加拿大 清华大学核能与新能源技术研究院 北京100084

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