摘要:目的:通过生物信息学方法对Netrin-1蛋白的结构和功能进行全面的预测分析,从而为癌症发病机制及治疗提供理论依据。方法:利用ProtParam、Genecards、STRING等数据库对Netrin-1蛋白的序列同源性、亚细胞定位、理化性质、空间结构及蛋白质相互作用网络及表达谱进行综合分析。结果:人Netrin-1蛋白由604个氨基酸组成,在进化过程中高度保守,属于Laminin_N超家族和NTR_like超家族,是一种亲水、不稳定的分泌蛋白。该蛋白主要二级结构为无规卷曲,存在较多潜在的磷酸化、乙酰化位点,其互作蛋白有DCC、UNC5H家族、FYN、BCAR1、MAP1B等,在结肠癌、乳腺癌、前列腺癌等实体肿瘤中表达较高。结论:综合Netrin-1蛋白的结构、功能信息,提示其可能通过调节多种肿瘤相关信号通路促进肿瘤恶性进展。
关键词:癌症 结构 功能 生物信息学
单位:中国医科大学附属第一医院泌尿外科; 辽宁沈阳110001; 中国医科大学/东北大学人工智能精准医学联合实验室; 辽宁沈阳110001; 中国医科大学实验动物部; 辽宁沈阳110001
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