线上期刊服务咨询,发表咨询:400-808-1701 订阅咨询:400-808-1721

岩陀ITS2片段PCR扩增条件优化及物种鉴别研究

方强强; 王燕 现代园艺 2019年第05期

摘要:以岩陀植物叶片为材料,利用试剂盒提取方法提取植物叶片中的DNA,对ITS2序列进行PCR扩增条件优化并对ITS2序列鉴别物种能力进行考察;通过单因素实验分别研究退火温度、DNA模板量、循环次数等因素对岩陀DNA条形码鉴别中所选的ITS2序列扩增反应的影响,并对扩增体系进行优化,采用Seqman7.1软件对测序峰图进行校对拼接,应用MEGA计算种内种间遗传距离,采用邻接法(neighbor-joining,NJ)构建系统发育树;结果表明:优化后的PCR扩增反应体系总体积为25μL,含Taq PCR Master Mix 12.5μL、DNA模板量5ng、上下游引物(10mol/L)各1μL、ddH2O9.5μL,ITS2序列在退火温度设置为60℃,循环次数为30次的条件下进行PCR扩增,获得清晰单一的电泳条带,ITS2测序成功率100%,比对后的序列长度475bp,GC含量约50%,种内种间变异存在重叠,没有明显的Barcoding gap;结论:通过试剂盒提取岩陀植物叶片DNA,在优化后的PCR扩增反应体系对ITS2序列进行扩增,可以满足后续对鬼灯檠属多基原植物岩陀的亲缘关系、物种鉴别和遗传多样性等领域的研究,但ITS2序列不适合岩陀种DNA条形码鉴别。

关键词:岩陀dna提取核糖体its2pcr扩增条件测序

单位:大理大学药学与化学学院; 云南大理671000

注:因版权方要求,不能公开全文,如需全文,请咨询杂志社

现代园艺

省级期刊

¥235.20

关注 41人评论|0人关注