摘要：【目的】研究香稻品种的遗传多样性。【方法】利用分布于12条水稻染色体上的60个SSR引物和22个水稻功能基因标记检测了32个香稻品种的遗传多样性。【结果】60对SSR引物共检测出188个等位基因，其中有效等位基因数126个。每对引物等位基因数在2～6之间,平均为3.13个。多态性信息含量（PIC）变幅为0.116～0.744，平均为0.467±0.175。32个品种间的遗传相似系数在0.51～0.96之间，平均为0.697。聚类分析将32个香稻品种在遗传相似系数0.58处分为籼、粳两类，分类结果与品种系谱分析比较吻合。【结论】SSR分子标记在香稻品种遗传多样性分析和育种应用方面具有重要价值。功能基因标记检测表明，部分功能基因在所研究材料中不存在等位变异。而存在等位变异的功能基因标记则表明不同产地来源、不同生态类型的香稻品种具有不同的等位基因。抗稻瘟病基因标记检测出宜香B、香恢1号和丝苗香3个品种同时含有两个抗稻瘟病等位基因，为香稻抗性育种提供了材料基础。

关键词：香稻 ssr标记 遗传多样性 聚类分析 功能基因 

单位：四川农业大学水稻研究所 四川温江611130 四川省农业科学院水稻高粱研究所 四川泸州646000 四川农业大学/西南作物基因资源与遗传改良教育部重点实验室 四川雅安625014