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豌豆属(Pisum)SSR标记遗传多样性结构鉴别与分析

宗绪晓 Rebecca Ford Robert R Redden 关建平 王述民 中国农业科学 2009年第01期

摘要:【目的】评价豌豆属(Pisum L.)2个种5个亚种下,共8个资源类群的遗传多样性水平,揭示豌豆属下资源群体结构及其遗传关系远近,验证传统植物学分类的可靠程度,为充分发掘、利用豌豆野生种质提供必要信息。【方法】利用21对豌豆多态性SSR引物,对来自世界5大洲62个国家的豌豆属94份栽培种质(P.sativum ssp.sativumvar.sativum)及其1个近缘野生种(P.fulvum),3个野生亚种(P.sativumssp.abyssinicum、P.sativumssp.asiaticum、P.sativumssp.transcaucasicum)和3个野生变种(P.sativumssp.elatiusvar.elatius.P.sativum ssp.elatius var.pumilio、P.Fativum ssp.sativum var.arvense)的103份野生种质进行SSR标记遗传多样性分析;利用NTSYSpc2.2d软件估算其遗传距离,进行主成分分析(PCA)并绘制三维空间聚类图;利用Popgene V1.32估算种质群间的Nei78遗传距离等参数并进行UPGMA聚类分析,采用MEGA3.1绘制种质群间聚类图;采用Popgene V1.32估算种质群的等位位点分布等参数,利用Fstat V2.9.3.2进行种质群间遗传多样性差异显著性测验。【结果】21对豌豆多态性SSR引物共扩增出104条多态性带,每对引物平均扩增出4.95个等位变异,其中有效等位变异占65.56%;PSAD270,PSAC58,PSAA18,PSAC75,PSAA175和PSAB72等SSR引物最为有效。SSR等位变异在豌豆属植物学分类单位中分布均匀,但分类单位种质群间的遗传多样性在多数情况下差异显著。豌豆属野生种P.fulvum的遗传多样性远低于栽培种P.sativum,豌豆栽培种下,P.sativum ssp.sativumvar.Sativum和P.sativum ssp.asiaticum的遗传多样性最高,P.sativum ssp.elatiusvar.elatius和P.sativum ssp.transcaucasicum次之,P.sativum ssp.elatius var.pumilio、P.sativum ssp.sativum var.arvense和P.sativum ssp.abyssinicum最低。PCA分析发现,豌豆属种质资源由4个差异明显的基因库构成。“ful

关键词:ssr遗传多样性植物学分类体系基因库

单位:中国农业科学院作物科学研究所、国家农作物基因资源与基因改良重大科学工程 中国北京100081 BioMarka Faculty of Land and Food Resources The University of Melbourne Melbourne Australia 3010 Australian Temperate Field Crops Collection Grains Innovation Park The Department of Primary Industries Private Bag 260 Horsham Australia 3401

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