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富贵竹中杆状DNA病毒湖北分离物的分子鉴定

陈秀 阮小蕾 赵芹 李华平 中国农业科学 2009年第06期

摘要:【目的】证明湖北发病富贵竹上是否存在杆状DNA病毒属(Badnavirus)病毒,分析来自富贵竹及其它作物Badnavirus病毒不同分离物间的分子差异。【方法】通过分段克隆测序的方法获得湖北富贵竹中Badnavirus病毒基因组全序列,利用BLAST工具及其它生物学软件进行序列分析。【结果】富贵竹Badnavirus病毒湖北分离物基因组为环状结构,全长7522bp;基因组正链包含7个ORFs,推测其编码蛋白的分子量分别为17.58、14.93、214.77、11.86、11.31、16.12和11.00kD。获得的基因组与福建富贵竹斑驳病毒(Dracaenamottlevirus,DrMV)大小仅相差9个核苷酸,两者基因组核苷酸序列一致率为99.7%,ORFs1~3编码氨基酸序列的一致率分别为99.3%、100%、99.2%,而与其它已报道的14种Badnavirus病毒分离物间的核苷酸全序列一致率为32.0%~44.0%。【结论】叶片表现褪绿斑驳等症状的湖北富贵竹中存在Badnavirus病毒,该病毒与DrMV为同种病毒,已报道的富贵竹中Badnavirus病毒分离物间分子差异非常小,这与已报道的其它作物中Badnavirus病毒不同分离物间存在非常大的分子差异不同。

关键词:富贵竹杆状dna病毒分子鉴定

单位:华南农业大学植物病毒研究室 广州510642

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