摘要：【目的】证明中国湛江地区菠萝上是否存在菠萝杆状DNA病毒（Pineapple bacilliform comosus virus,PBCoV）,并获得PBCoV的基因组全序列,分析该病毒与其它Badnavirus病毒分离物间的分子差异。【方法】设计特异引物,通过反向PCR及分段克隆两种方法扩增PBCoV,克隆后测序获得PBCoV基因组全序列,利用不同生物学软件进行序列分析。【结果】PBCoV基因组为环状结构,全长7543bp; 含有3个典型的ORFs,推测其编码蛋白的分子量分别为20.4、14.0和217.6kD。其基因组与GenBank登录的PBCoV ORF3部分核苷酸序列同源性87%-97%,其ORF3编码的氨基酸序列与已报道的Badnavirus病毒ORF3氨基酸序列间一致率小于50.8%。Southern blot分析显示该病毒基因组能整合到植物基因组中。【结论】在中国湛江地区菠萝上存在PBCoV,该病毒属于Badnavirus属病毒,与香蕉线条病毒（Banana streak virus）Mys分离物（BSV-Mys）亲缘关系最近。这是PBCoV基因组全序列的首次报道。

关键词：菠萝 菠萝杆状dna病毒 杆状dna病毒属 全序列 

单位：华南农业大学植物病毒研究室 广州510642