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陆地棉叶绿体基因组密码子使用偏性的分析

尚明照 刘方 华金平 王坤波 中国农业科学 2011年第02期

摘要:【目的】通过分析陆地棉叶绿体基因组密码子使用偏性,探讨影响密码子偏性形成的主要因素。【方法】以陆地棉叶绿体基因组为研究对象,利用Mobyle及其它软件,分析叶绿体50个基因密码子的使用模式。【结果】陆地棉叶绿体基因组密码子GC1与GC2之间的相关系数达到极显著水平,GC3含量最低,与GC12的相关系数为0.14,双尾检验未达到显著水平;单个基因ENC比值多分布在-0.05—0.05;对应性分析,第一轴上显示了10.27%的差异,与GC3、ENC的相关系数分别为0.223和-0.147,均未达到显著水平。【结论】陆地棉叶绿体密码子第三位偏好使用嘧啶,而最优密码子多以A或T结尾;密码子使用模式可能是由选择和突变及其它因素共同作用形成的。

关键词:陆地棉密码子偏性gc含量最优密码子

单位:华中农业大学植物科学技术学院 武汉430070 中国农业科学院棉花研究所 河南安阳455000 中国农业大学农学与生物技术学院 北京100871

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