线上期刊服务咨询,发表咨询:400-808-1701 订阅咨询:400-808-1721

哈茨木霉几丁质合酶基因ThChsC的克隆及序列分析

冀颖 李梅 田云龙 刘卫德 牛静 蒋细良 中国农业科学 2011年第17期

摘要:【目的】克隆哈茨木霉几丁质合酶基因全序列,并对序列进行生物信息学分析。【方法】利用多聚酶链式反应(PCR)和染色体步移技术(genome walking)克隆几丁质合酶基因全序列;应用生物信息学软件对获得的基因序列及编码的蛋白序列进行分析;通过同源建模,对蛋白质的三维结构进行预测。【结果】从哈茨木霉(TrichodermaharzianumTh-33)中扩增得到几丁质合酶基因ThChsC(GenBank登录号HQ419000),编码区(CDS)长为2835bp,由4个外显子和3个内含子组成,开放阅读框(ORF)长2688bp,编码895个氨基酸。序列比对和同源性分析显示,该基因与串珠状赤霉(Gibberella moniliformis,ACY08039.1)和禾生刺盘孢菌(Colletotrichumgramiaicola,AAL23718.1)几丁质合酶基因相似性最高,分别为80%和81%;相应的氨基酸序列同源性均为80%,系统进化分析表明,劢珊Jf属于III型几丁质合酶亚家族。几丁质合酶ThChsC含有1个chitin—synth-1结构域,1个Chitin—synth-1N结构域,1个Chitin—synth-2结构域,3个跨膜结构域,不含信号肽,为膜结合蛋白。对预测的三维结构分析表明,ThChsC含有糖基转移酶的保守DHD结构域。【结论】从哈茨木霉Th-33中克隆得到几丁质合酶基因ThChsC,对该基因的深入研究有助于探索哈茨木霉几丁质合成的机制。

关键词:哈茨木霉几丁质合酶基因克隆序列分析

单位:中国农业科学院植物保护研究所/农业部作物有害生物综合治理综合性重点实验室 北京100081 中国农业科学院农业环境与可持续发展研究所 北京100081

注:因版权方要求,不能公开全文,如需全文,请咨询杂志社

中国农业科学

北大期刊

¥1288.00

关注 25人评论|2人关注