摘要：【目的】通过中国粳稻地方品种的遗传多样性分析，阐明各省份粳稻地方品种的遗传结构及其亲缘关系，为中国粳稻杂交育种的亲本选配提供科学依据。【方法】利用43对SSR多态性标记，对原产于中国17个省（市、自治区）的187份粳稻地方品种进行等位基因多样性、遗传结构和聚类分析。【结果】共检测到等位基因351个，每个位点等位基因变幅为2-21，平均每个位点等位基因数为8．2；基因多样性指数变异范围为0．117-0．908，平均为0．550；多态信息含量（PIC）变异范围为0．114-0．902，平均为0．523。在RM72、RM241、RM219、RM412和RM232等位点所检测到的遗传多样性参数值较大。西南、华南、华中粳稻地方品种的遗传多样性明显高于华北和东北地区；云南省粳稻地方品种遗传多样性最丰富，天津和吉林的粳稻地方品种的遗传多样性相对较低。基于Nei’S遗传距离的系统聚类把供试材料分为8个小类群，南方粳稻地方品种主要聚类于第i、ii、iii、iv和V等5个小类群，北方粳稻地方品种主要聚类于第vi、vi和砌等3个小类群。基于模型的群体结构分析，供试材料被分为11个亚群，有144份材料被分到相应的11个亚群，其余43份材料被分到混合亚群。【结论】南方稻区粳稻地方品种的遗传多样性明显高于北方稻区，其中西南稻区的粳稻地方品种遗传多样性最为丰富，而云南是粳稻地方品种遗传多样性最丰富的省份。北方与南方粳稻地方品种问存在较大的遗传差异，粳稻地方品种间亲缘关系与地域性存在一定的相关性，这种相关性在北方粳稻地方品种中更为突出。RM72、RM241、RM219、RM412和RM232适合应用于粳稻地方品种的遗传多样性检测。

关键词：粳稻 地方品种 遗传多样性 遗传结构 

单位：中国农业科学院作物科学研究所/国家农作物基因资源与基因改良重大科学工程/农业部作物种质资源利用重点开放实验室 北京100081