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鹌鹑VIPR-1的克隆、序列特征和组织表达分析

周敏 李莹 沈栩 徐海平 张成广 张细权 中国农业科学 2012年第03期

摘要:【目的】对鹌鹑血管活性肠肽1型受体(vasoacitve intestinal peptidetype 1 receptor,VIPR-1)cDNA全长基因进行克隆及分析,为鹌鹑的分子育种提供基础资料。【方法】通过比较基因组学,采用RT-PCR和RACE技术,获得鹌鹑了VIPR-1 cDNA全长序列;通过生物学软件对其核苷酸序列和氨基酸序列进行了比对;采用实时定量PCR方法检测了VIPR-1在8个组织中的表达。【结果】鹌鹑VIPR-1的eDNA全长2427bp,包含了1341bp的开放性阅读框,编码446个氨基酸;序列分析显示,克隆获得的鹌鹑VIPR-1编码区序列与鸡该编码区序列存在41个碱基的差异,造成4个氨基酸残基的不同;VIPR-1氨基酸序列与鸡、火鸡、斑胸草雀的氨基酸的一致性分别为99.1%、92.2%、88%,与其它物种的一致性在60%-78%;各物种VIPR-1蛋白进化树符合物种进化规律;VIPR-1理化性质表明该蛋白为一偏碱性蛋白,蛋白二级结构主要由口一螺旋、β-折叠和β-转角构成;在N-端存在一个由22个氨基酸残基(MKsARLRVLLPLLGcLLSAASS)组成的信号肽,7个a-螺旋构成的跨膜域和C-端结构域,在跨膜域有胆固醇结合位点;在所检测的8个组织中VIPR-1,mRNA均有表达,在小肠中表达量最高。【结论】成功地克隆了鹌鹑VIPR-JeDNA全长序列,该基因在小肠组织的表达高于其它组织,在跨膜域存在胆固醇结合位点。

关键词:鹌鹑血管活性肠肽1型受体基因分子特征组织表达分析

单位:江西教育学院生物技术研究所 南昌330029 华南农业大学动物科学学院/广东省农业动物基因组学与分子育种重点实验室 广州510642

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