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绵羊UCP1基因碱基突变与其蛋白结构和功能

袁亚男 刘文忠 刘建华 乔利英 武建亮 中国农业科学 2012年第14期

摘要:【目的】检测两个绵羊群体中解偶联蛋白1(uncoupling protein 1,UCP1)基因的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP),预测和分析碱基改变对蛋白结构和功能的影响。【方法】利用PCR-SSCP结合测序的方法检测UCP1基因编码区的SNPs,用生物信息学方法分析UCP1蛋白的理化性质和结构。【结果】UCP1基因编码区存在4个SNPs,其中c.214G〉A(Val72Met)和c.273C〉T位于外显子2,c.624C〉T和c.757G〉A(Ala253Thr)位于外显子5。进一步分析导致氨基酸改变的c.214G〉A和c.757 G〉A突变发现,此两个突变只对UCP1蛋白的理化性质和转录因子结合位点有细微改变,未引起UCP1蛋白空间构象的变化,对蛋白表达的影响不大。【结论】基于对人类中两个与肥胖相关的外显子突变型蛋白结构的比较说明,UCP1蛋白结构的改变可能影响其功能。

关键词:绵羊生物信息学蛋白结构

单位:山西农业大学动物科技学院 山西太谷030801

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