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畜禽保种群体遗传多样性的模拟

鲁云风 王茜 黄文波 史利华 吴克亮 中国农业科学 2012年第18期

摘要:【目的】基于微卫星标记特点,采用计算机模拟技术,探讨畜禽保种群遗传多样性的变化过程。【方法】选择30个均匀分布于基因组、具有4—10个等位基因的标记位点,位点间无相互作用;模拟产生的畜禽保种群公母比例为1:5、随机交配、各家系随机等量留种、群体规模保持世代恒定,世代问无重叠,群体有效大小分别为Ne=10、20、50、100和200,保种繁殖50个世代,1000次重复。采用多态性位点数(num-p)、平均等位基因数(他)、有效等位基因数(Ae)、观测基因杂合度(Ho)、期望杂合度(He)、稀有等位基因数(RA)、缺乏丰富位点数(NRP)作为遗传多样性度量指标。【结果】保种群体的遗传多样性总体趋势随保种世代而逐渐降低,不同群体规模遗传多样性的降低速度差异显著,相比基础群,胎值越大,num-p、Na、Ae、110、He和RA的下降速率越慢,且当90=100和200时,num-p基本维持50个世代不变,删则分别增加0.86%和2.49倍;而此值越大,NRP的增加速率越慢。【结论】遗传漂变导致了群体内遗传多样性的丢失。小群体中遗传漂变导致的遗传多样性丢失速度比大群体更高,发生在闭锁群体水平上的有效群体规模的减少将加快基因漂变速度,从而降低保种群体内的遗传多样性。

关键词:遗传多样性保种畜禽品种资源计算机模拟

单位:中国农业大学动物科学技术学院 北京100193 南阳师范学院生命科学与技术学院 河南南阳473061

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