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高粱甲基化连锁群A、B的构建及甲基化位点、甲基化模式的分析

段永红 王铭 孙毅 杨武德 中国农业科学 2012年第18期

摘要:【目的】构建高粱甲基化连锁群A和B,并分析其上的甲基化位点分布及甲基化模式变化。【方法】从高粱品种强优势组合B2V4×1383-2杂交组合获得的F:分离群体(共150个体)为材料,以SSR标记为锚定标记,采用SSR和MSAP标记技术,并用Mapmaker/Exp(Version3.0)和Map/Draw2.1软件进行分析。【结果】构建出高粱甲基化连锁群A-a和A-b及甲基化连锁群B-a和B-b,其中,甲基化连锁群A覆盖高梁基因组93.7cM,包含10个SSR标记、20个MSAP标记,甲基化连锁群B覆盖高粱基因组90.4cM,包含4个SSR标记、39个MSAP标记;连锁群A-a上甲基化位点仅来源于肋汰I/MspI酶切组合,而其它连锁群上甲基化位点来源于此DRI/MspI和肋DRI/HpaII2种酶切组合;甲基化连锁群A-b和B-b上各存在一个稍密集的甲基化位点区域,而连锁群B-a上存在一个较密集的甲基化位点区域;基于同一酶切的高梁亲本间有多态性差异,F2群体存在分离,高梁亲本与杂交种F-的甲基化模式有2种类型的变化。【结论】MSAP标记可以检测到大量的甲基化差异片段,结合锚定的SSR标记,能够有效地构建植物基因组的甲基化遗传连锁群或遗传连锁图谱;在连锁群上检测到3个密集的甲基化位点区域,分别位于SSR标记Xtxp302、Xtxp96及Xtxp304附近;在获得的连锁群中,发生去甲基化反应的甲基化位点数高于甲基化水平提高的位点数。

关键词:高粱ssrmsapdna甲基化

单位:山西农业大学农学院 山西太谷030801 山西省农业科学院生物技术研究中心 太原030031 农业部黄土高原作物基因资源与种质创制重点实验室 太原030031

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