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桔小实蝇电压门控钠离子通道基因cDNA克隆及其生物信息学分析

蒋玄赵 魏丹丹 申光茂 豆威 王进军 中国农业科学 2012年第19期

摘要:【目的】克隆获得桔小实蝇(Bactrocera dorsalis)电压门控钠离子通道基因cDNA序列,明确其典型特征,为研究桔小实蝇抗性分子机理奠定基础。【方法】采用RT-PCR和PCR技术,克隆桔小实蝇钠离子通道基因cDNA序列,利用相关软件对其序列进行生物信息学分析。【结果】克隆得到1条长为6446bp的cDNA序列,包含1个6405bp的完整开放阅读框,共编码2134个氨基酸。同源比对发现,桔小实蝇与果蝇(Drosophila melanogaster,NP-001188635)和家蝇(Musca domestica,AAB47604)钠离子通道基因相似度分别高达91.7%和86.9%,而与人的钠离子通道Navl.2基因(Homo sapiens,NP-066287)相似度为42.3%。所克隆序列包含昆虫钠离子通道所有典型特征。【结论】成功地从桔小实蝇中克隆得到钠离子通道基因完整开放阅读框。该钠离子通道基因存在丰富的选择性剪接,发现了3个可能与抗性相关的碱基取代。钠离子通道基因有可能发展成为一种昆虫系统发育研究的分子标记。

关键词:桔小实蝇钠离子通道基因克隆生物信息学分析系统发育分析

单位:西南大学植物保护学院昆虫学及害虫控制工程重庆市市级重点实验室 重庆400715

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