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玉米大斑病菌转录因子StSte12的表达特性分析及其调控基因的筛选

张长志 李坡 谷守芹 巩校东 杨阳 范钰 田兰 张晓玉 韩建民 董金皋 中国农业科学 2013年第08期

摘要:[目的]确定玉米大斑病菌转录因子stStel2在基因组中的位置,分析目的蛋白质StStel2的结构特征;明确StSTEl2在病菌不同发育时期的表达情况;筛选可能受StStel2转录因子调控的基因,分析其匹配序列的结构特征,并比较它们在病菌的中表达情况。[方法]利用生物信息学方法,确定StStel2在玉米大斑病菌基因组中的位置并解析目的蛋白质stStel2的结构特征;利用Westernblot技术分析StSTEl2在病菌不同发育时期的表达规律;根据酿酒酵母Stel2转录因子的下游调控基因,筛选病菌中可能受StStel2调控的功能基因;并利用生物信息学方法得出下游调控基因的结合位点;利用RT—PCR技术,分析这些基因在StSTEl2RNAi转化子与野生型菌株中的表达情况。[结果]StSTEl2的ID为105656,该基因位于scaffold-13正链的1061747—1064127位置;该蛋白具有stel2-1ike蛋白特有的保守结构域(STEhomeodomain和ZnF—C2H2锌指结构)及空间结构;StSTE12在附着胞时期表达量最大;筛选了部分stStel2调控基因,与stStel2的匹配序列为T\CGAAACAkG,中间部分GAAAC非常保守;Stl(AR5在野生型中表达量小于StSTEl2RNAi转化子,StBEM2、StBED8、StCHS7相反;StRAX2的表达量在野生型和转化子中一致。[结论]StStel2具有stel2-like所特有的DNA结合结构域和空间结构;该蛋白在附着胞发育中发挥重要功能;筛选了部分stStel2的调控基因,其匹配序列可概括为T\CGAAACA\C,且证实了这些基因受StStel2调控。

关键词:玉米大斑病菌转录因子stste12调控基因

单位:河北农业大学真菌毒素与植物分子病理学实验室 河北保定071001 河北省农林科学院植物保护研究所 河北保定071000

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