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猪瘟病毒分子流行病学信息系统的建立与应用

王琴 涂长春 黄保续 徐璐 盖华武 范学政 郭焕成 徐和敏 李金花 赵启祖 宁宜宝 郑然 沈青春 中国农业科学 2013年第11期

摘要:【目的】加强对猪瘟(CSF)流行病学信息的统一管理,随时掌握全球CSF数据,分析CSF传播来源,进行疫情预测预报。【方法】将猪瘟流行病学信息数据与数据库技术、GIS技术、生物信息学技术相结合。采用ArcGISDesktop、ArcMapObjects、Delphi和DNAStar 6.0等软件工具,在中国数字地图空间数据的支持下,建立了猪瘟流行病学信息系统,并命名为CSFinfo。【结果】该系统包含754株中国流行毒株、554株中国CSFV E2基因序列和欧盟CSF参考实验室数据库的642株CSFV E2基因序列,使中国成为继德国之后第二个拥有这种数据库的国家。【结论】CSFinfo可方便、快捷地对某地某时的CSF疫情进行查询,分析疫病发生规律;由于CSFinfo含有DNAStar6.0序列分析软件,可实现空间数据与基因序列分析应用的完整结合,是该系统的一大创新。CSFinfo的建立对CSF流行病学监测提供了必要的技术支持,提高了对CSFV流行毒株总体分布、疫情发生发展趋势提供科学的统计分析手段,为政府CSF防控提供可靠的疫情资料具有十分重要的意义。

关键词:猪瘟猪瘟病毒流行病学地理信息系统数据库

单位:中国兽医药品监察所 北京100081 军事医学科学院军事兽医研究所 长春130122 中国动物卫生与流行病学中心 山东青岛266032

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