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裸燕麦SSR标记连锁群图谱的构建及β-葡聚糖含量QTL的定位

吴斌 张茜 宋高原 陈新 张宗文 中国农业科学 2014年第06期

摘要:【目的】构建裸燕麦分子遗传图谱,发掘燕麦β-葡聚糖基因紧密连锁的分子标记,为高β-葡聚糖含量燕麦种质资源的利用及裸燕麦分子标记辅助育种提供理论和实践依据。【方法】以高β-葡聚糖地方品种夏莜麦为父本,育成品种赤38莜麦为母本构建的包含215个F2:3,家系为图谱构建群体,利用SSR分子标记进行遗传分析,构建分子遗传图谱。通过美国谷类化学会(AACC)发表的标准葡聚糖含量测定方法(AACCMethod32—23)测定各家系的β-葡聚糖含量,利用复合区间作图法进行燕麦β-葡聚糖含量性状进行遗传定位与分析。【结果】利用筛选出的231对SSR引物在Fz后代群体上进行检测,共得到261个多态性标记位点,利用JoinMap4.0软件对上述获得多态性分子标记进行遗传连锁分析,在LOD≥5.O情况下,构建遗传图谱,得到包含26个连锁群、182个标记位点的遗传图谱,覆盖基因组1869.7cM,标记问平均距离为10.6cM,每个连锁群上的标记数在2—14个之间,连锁群长度在10.6—235.1cM。对亲本及后代群体β一葡聚糖含量的测定结果表明,β-葡聚糖含量在后代群体中表现出明显的分离,且呈现为连续变异,变异系数为18.72%,说明β-葡聚糖含量性状是受多基因控制的数量性状,群体符合QTL定位的要求。利用QTL分析软件WinQTLCart2.5对SSR数据进行分析,采用复合区间作图法(compositeintervalmapping,CIM)对全基因组进行QTL扫描,以LOD值5作为阈值对β-葡聚糖含量可能存在的QTL进行定位和效应估计,检测到4个与β-葡聚糖含量相关的QTL位点,其中qBC--1位于连锁群LG20上,与最近的标记AM591的距离10.0cM。加性效应值为0.21,可以解释的表型变异为10.9%;qBC-2和qBG-3位于连锁群LG23上,其中qB&-2与最近的标记AMl823的距离4.6cM,qgC--3与最近的标记AM641的距离1.9cM,加性效�

关键词:裸燕麦连锁群图谱ssr数量性状

单位:中国农业科学院作物科学研究所 北京100081

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