摘要：【目的】准确鉴定水稻材料的籼粳属性及利用遗传距离预测杂种优势，为开展水稻超高产育种和籼粳亚种间杂种优势利用提供基础。【方法】利用19对籼粳稻特异插入／缺失（Insettion／Deletion，InDel）引物，对12个淅优系列杂交稻及其双亲的籼粳属性进行了InDel分子标记鉴定，根据被检测水稻样品在多个InDel位点上的籼型或粳型基因频率，参考卢宝荣的方法，将供试样品分别判定为“籼稻”、“偏籼”、“中间偏籼”、“中间偏粳”、“偏粳”和“粳稻”。采用Nei的方法求算13个亲本间（1个不育系和12个恢复系）的InDel遗传距离，用UPGMA法进行遗传相似性聚类，用SPSS17．0统计分析软件对InDel条带赋值进行主成分分析，依据第一和第二主成分的特征向量的平均分量值作平面散点图。统计杂种F1稻谷产量、每穗总粒数、每穴有效穗、结实率、千粒重及单穗重各产量性状的对照优势，以此分析InDel遗传距离与杂种优势的相关性。【结果】（1）参试材料籼粳属性的判别：不育系浙04A被鉴定为“粳稻”，8个恢复系被判定为“籼稻”或“偏籼”，由其所配组的8个杂交组合被判定在“中间偏籼”到“偏粳”之间，证实了这8个组合为典型的籼粳交组合；另外4份恢复系被判定为“偏粳”，所配组的4个杂交组合被判定为“粳稻”。（2）参试材料的聚类分析：当GS为0．350时，35份试验材料被分为“粳稻”和“籼稻”2个主群，甜为0．638时，粳稻主群又被划分为“粳稻／偏粳”和“中间偏粳”2个亚群。其中，粳稻／偏粳亚群包括不育系浙04A、4个粳粳交恢复系及粳粳交杂种F1、3个粳稻对照种和粳稻秀水09；中间偏粳亚群包括8个籼粳交杂种F1。籼稻主群则包括8个籼粳交组合的恢复系、3个籼稻对照种和籼杂组合汕优63。（3）InDel遗传距离与杂种优势的相关性：

关键词：水稻 indel 分子标记 杂种优势 籼粳交 

单位：浙江省农业科学院作物与核技术利用研究所 杭州310021