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飞蝗表皮蛋白Obstructor家族基因的分子特性及基于RNAi的功能分析

王燕 李大琪 刘晓健 李涛 马恩波 范仁俊 张建珍 中国农业科学 2015年第01期

摘要:【目的】获得飞蝗(Locusta migratoria)表皮蛋白 Obstructor(Obst)家族基因的 cDNA 序列,并研究其序列特征和 mRNA 表达特性,探讨其生物学功能,为害虫防治提供新的分子靶标。【方法】采用生物信息学方法搜索飞蝗转录组数据库获得 Obst 家族基因 cDNA 片段,并进行 BLAST 分析得到 Obst 家族基因的 cDNA 序列;采用 RACE 技术扩增该家族基因的3′cDNA 序列,拼接后获得全长;SignalP 在线软件分析蛋白的信号肽,SMART 网站预测其功能域,并使用 Mega 5.10软件中 Neighbor-Joining 方法,与黑腹果蝇(Drosophila melanogaster) Obst 家族基因和赤拟谷盗(Tribolium castaneum)CPAP3家族基因(Obst 家族基因的同源基因)氨基酸序列进行聚类分析;采用 real-time quantitative PCR(qPCR)方法检测 LmObst 家族基因在5龄若虫不同组织部位和不同龄期体壁的表达情况,绘制表达图谱;采用 RNA 干扰(RNAi)技术探讨 LmObsts 对飞蝗发育的影响。【结果】在飞蝗转录组数据库中搜索得到8个Obst 家族基因的cDN段,通过NCBI进行BLAST分析显示与赤拟谷盗CPAP3、黑腹果蝇 Obst 高度同源,属于 LmObst 家族基因片段,其中5个是全长序列,3个序列缺失3′端;采用 RACE 技术获得3′末端 cDNA 序列;将得到的8个 LmObst 家族基因全长序列进行功能域分析,发现具有 Obst 家族表皮蛋白的特点,即有1个信号肽与3个几丁质结合域 ChtBD2;并与黑腹果蝇、赤拟谷盗同源基因进行进化树的构建,根据进化树分析结果,分别命名为 LmObst-A1、LmObst-A2、LmObst-B、LmObst-C、LmObst-D1、LmObst-D2、LmObst-E1和 LmObst-E2。qPCR 结果显示 LmObst-E1和 LmObst-E2在前肠和后肠高特异性表达,LmObst-D1在体壁和前肠高表达,其他 LmObsts 在体壁或外胚层内陷形成的前肠和后肠高表达,在胃盲囊、中肠、马氏管和脂肪体中低表达;LmObst 家族基因在5龄若虫�

关键词:飞蝗表皮蛋白obstruetorquantitativepcr

单位:山西大学应用生物学研究所 太原030006 农业有害生物综合治理山西省重点实验室 太原030006 山西省农业科学院植物保护研究所 太原030031

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