摘要：【目的】SRO(similar to rcd one)是植物所特有的一类小蛋白家族,其在植物的生长发育,及应对非生物胁迫中发挥着重要功能。基于玉米全基因组数据库,鉴定玉米SRO家族基因,分析其序列、基因定位、蛋白结构及其系统进化关系,同时解析ZmSROs在玉米组织表达特异性及其在高盐和干旱胁迫下的表达变化,为阐明SRO基因在玉米生长和逆境响应中的功能研究奠定基础。【方法】利用拟南芥SRO家族基因为探针,在玉米全基因组查找并下载玉米SRO基因序列,并从MaizeGDB中获取玉米SRO基因相关信息,包括CDS、氨基酸序列及染色体位置等。通过生物信息学工具(GSDS2.0、Expasy-protparam、SOPMA、Plant-mPLoc、EMBL-EBI、MEME)对获得序列的基因结构、蛋白质分子量、等电点、二级结构、亚细胞定位、保守结构域、保守基序原件等进行预测和分析。同时利用Clustalx(1.83)和MEGA 6.0软件进行同源序列比对并构建系统进化树。运用实时荧光定量PCR技术分析玉米SRO组织表达特异性及其在高盐和干旱胁迫下SRO的表达变化情况。【结果】从玉米全基因组共鉴定6个SRO家族基因,分别命名为ZmSRO1a—ZmSRO1f。ZmSROs分布于第1、4、5和9染色体,包含2—5个内含子。序列分析发现CDS序列长度在1 215—1 791 bp;编码氨基酸数目为404—596 aa;分子量为45.23—66.78 kD;等电点为7.01—9.17。亚细胞定位分析发现ZmSRO1a/ZmSRO1b/ZmSRO1c/ZmSRO1d定位于叶绿体,ZmSRO1e则定位于过氧化氢酶体,ZmSRO1f定位于细胞核。系统进化树分析发现ZmSROs分为3个亚类,Ⅰa亚类包括ZmSRO1a/ZmSRO1b/ZmSRO1c,Ⅰb亚类包括ZmSRO1f,Ⅰc亚类包括ZmSRO1d/ZmSRO1e。保守结构域分析结果显示ZmSRO1a/ZmSRO1b/ZmSRO1c/ZmSRO1d/ZmSRO1e包含PARP和RST结构域,缺少WWE结构域,ZmSRO1f包含WWE和PARP催化中心,RST结构域缺失。ZmSROs蛋白共找到5个保守基序,命名为基序1—5。ZmSRO1a/ZmSRO1b/ZmSRO1c包含所有保守基序,ZmSRO1

关键词：玉米 sro基因 非生物胁迫 基因表达 

单位：中国热带农业科学院南亚热带作物研究所/农业部热带果树生物学重点实验室; 广东湛江524091