摘要：采用48个SSR标记分析了海南11个普通野生稻自然居群的遗传多样性。结果显示海南普通野生稻自然居群具有较丰富的遗传变异（Na=8．3，He=0．716）。居群内多数等位基因（77．6％）频率较低，其中，70个等位基因仅出现在1个居群中。62．9％的等位基因显著偏离哈迪一温伯格平衡，多数居群及等位基因实际杂合度大于期望杂合度，表明居群内自交率低、杂合体过剩。居群间遗传变异差异明显，在11个自然居群中，崖城居群遗传多样性最低（Na=1．7，He=0．348），和庆、椰林B两居群遗传变异最为丰富（和庆：Na=4．0，He=0．577；椰林B；Na=4．0，He=0．531）。Mantel测验表明，居群间Nei遗传距离与地理距离呈极显著相关（r=0．386，P=0．004）。东、西海岸居群间遗传分化显著但较小（Fst=0．048，P=0．024），而居群间遗传分化则较大（Fst=0．335，P〈0．001）。11个自然居群间基因流非常有限（Nm=0．404），表明居群间隔离程度较大。基于居群等位基因数目、基因多样性指数以及基因频率特点，认为海南11个自然居群中和庆和椰林B居群应是优先保护对象。

关键词：普通野生稻 微卫星标记 遗传多样性 分子方差分析 

单位：中国水稻研究所水稻生物学国家重点实验室; 浙江杭州310006