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东南亚与南亚稻属AA基因组种间的遗传多样性差异

吕建珍 张晓丽 王海岗 袁筱萍 徐群 王一平 余汉勇 魏兴华 中国水稻科学 2008年第03期

摘要:选用36对水稻微卫星(SSR)引物,对稻属428份东南亚及南亚AA组种进行遗传多样性分析。试验结果显示选取的SSR标记均具有多态性,多态性位点百分率(P)达100%。36个多态位点共扩增出311个等位基因,每个位点3-17个,平均8.6。Nei基因多样性指数(He)平均为0.650,变幅为0.337(RM455)-0.865(RM169)。东南亚稻属AA组的SSR多样性大于南亚,两地区又以普通野生稻的多样性指数(He)最大。种(类型)间遗传分化东南亚小于南亚,其中以尼瓦拉野生稻与亚洲栽培稻的遗传分化程度最大。特异等位基因的数量、涉及的位点数及频率均表明东南亚及南亚稻属AA组间具有较大的遗传差异,而某些特异位点(如RM161)等位基因所显示的较高频率,则表明该位点较高的鉴别效率。

关键词:稻属aa基因组微卫星标记遗传多样性东南亚南亚

单位:中国水稻研究所水稻生物学国家重点实验室 浙江杭州310006 山西农业大学 山西太谷030801

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