摘要：采用40个SSR标记,分析了329份我国近50年来常规稻主栽品种的遗传变异。结果显示,39个SSR标记具有多态性,在多态性位点共检测到223个等位基因,每个位点2～11个,平均5.7个;平均Nei基因多样性指数（He）为0.632。籼粳亚种间的SSR变异差异明显,籼稻平均等位基因数（Na）和Nei基因多样性指数（Na=5.4,He=0.440）均高于粳稻品种（Na=4.4,He=0.397）。Nei遗传相似系数表明总体样本具有较小的遗传相似度（I=0.366）,而骨干亲本具有较高的遗传相似度（籼：I=0.590;粳：I=0.590）。这导致了籼粳亚种内较高的遗传一致性（籼：I=0.558;粳：I=0.600）。早、中、晚稻各类型遗传相似度差异明显,晚籼和早粳类型具有较高的遗传变异。籼粳稻品种尤其是粳稻的聚类结果显示出较强的季节型和地域特征。这些均提示育种家应选择更广泛的亲本源以拓宽选育品种的遗传基础。

关键词：水稻 主栽品种 微卫星标记 遗传相似性 

单位：中国水稻研究所水稻生物学国家重点实验室 浙江杭州310006