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利用连锁和关联分析定位粳稻芽期及幼苗前期耐盐性QTL

郑洪亮 刘博文 赵宏伟 王敬国 刘化龙 孙健 邢军 邹德堂 中国水稻科学 2014年第04期

摘要:通过连锁分析和关联分析两种方法寻找与水稻芽期和幼苗前期耐盐性QTL,并进一步挖掘优异等位变异及载体材料。连锁分析以高产优质水稻品种东农425为轮回亲本,耐盐性水稻品种长白10号为供体亲本构建BC2F2:3群体,利用137个SSR标记构建遗传连锁图谱,采用ICIM法对相对发芽率(RGR)、相对苗高(RSH)、相对根数(RRN)和相对根长(RRL)等4个与水稻芽期和幼苗前期耐盐性相关的性状进行QTL定位分析,共检测到11个QTL。关联分析以341份粳稻种质组成的自然群体为研究材料,利用160个SSR标记进行群体基因型检测,采用Tassel 2.1的GLM和MLM模型进行标记与性状的关联分析,共检测到22个关联位点,并验证了连锁分析中的5个QTL,进一步鉴定得到9个优异等位基因。通过比较图谱发现,经验证的5个QTL中有4个与前人定位在同一或相邻的染色体区域,而qRRL7在前人研究中未见报道。

关键词:粳稻芽期幼苗前期耐盐qtl

单位:东北农业大学水稻研究所 哈尔滨150030

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