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极端粒形水稻粒宽基因 GW2的序列分析和效应

张亚东 梁彦丽 郑佳 丁丹 赵春芳 陈涛 赵庆勇 朱镇 周丽慧 姚姝 赵凌 于新 王才林 中国水稻科学 2014年第06期

摘要:粒形是影响水稻产量的重要因子,对粒形相关基因的发掘和利用一直倍受重视.在已克隆的粒形基因中,GW2是一个控制粒宽的重要基因.通过同源克隆的方法,获得极端大粒水稻 TD70和极端小粒水稻 Kasalath 的 GW2基因 cDN段,分析序列差异,设计功能标记,检测240个来源于 TD70/Kasalath 的重组自交系(RILs)和部分籼稻骨干恢复系、江苏省主栽粳稻品种的基因类型及其效应.结果表明,TD70的 GW2与大粒粳稻 WY3完全一致,与已知序列(GenBank:EF447275)相似性达99.77%,在碱基的第114位,T 突变为 C,但并不改变氨基酸性质;在第316位缺失碱基 A,造成316位以后的所有碱基前移一位,氨基酸均发生变化,在碱基的第346、第347、第348位形成 TAA 的终止密码子,提前结束了TD70的 GW2蛋白的表达.而 Kasalath 的 GW2 序 列 仅 在碱基的第114位,由 T 突变为 C,但并不改变氨基酸性质;GW2 Kasalath 的316位没有突变,表达没有提前终止;设计的 dCAPs 标记,产物经内切酶 Apo I 酶切,TD70为21bp 和30bp 两个片段,而 Kasalath 条带为51 bp;240个 RILs 中含 GW2 TD70基因的株系有82个,含 GW2 Kasalath 基因的株系有158个,两者在粒宽和粒重表型上存在显著差异;8个籼稻骨干恢复系和10个江苏省主栽粳稻品种中都不存在 GW2 TD70基因.GW2 TD70基因对籽粒宽度有一定的调控作用,水稻育种中可以利用 GW2 TD70基因来提高籽粒粒重.

关键词:水稻极端粒形gw2基因序列分析粒形

单位:南京农业大学农学院 南京210095 江苏省农业科学院粮食作物研究所/江苏省优质水稻工程技术研究中心/国家水稻改良中心南京分中心 南京210014

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