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干旱胁迫下杂草稻和栽培稻根系基因表达差异研究

丁国华; 孙健; 杨光; 张凤鸣; 白良明; 孙世臣; 姜树坤; 王彤彤; 郑洪亮; 夏天舒; 沈希宏; 马殿荣; 陈温福 中国水稻科学 2016年第05期

摘要:利用Affymetrix水稻表达谱芯片(GeneChip Rice Genome Array)研究抗旱杂草稻HEB07-2与巴西陆稻(IAPAR9)在PEG模拟干旱胁迫下根系基因表达变化。结果表明,杂草稻HEB07-2转录组对干旱信号的响应程度与方向均与巴西陆稻存在很大差异,HEB07-2以正向调控为主,而巴西陆稻以负调控为主。干旱胁迫下杂草稻HEB07-2与巴西陆稻分别有6878个和2923个基因表达,其中HEB07-2受干旱胁迫诱导上调的基因有4693个,下调的基因有2185个;而巴西陆稻则分别有983个和1940个。在差异基因表达的倍数上也是HEB07-2高于巴西陆稻。进一步的GO分析表明,在干旱胁迫下,HEB07-2和IAPAR9根系基因响应途径的差异表现为HEB07-2在钾离子转运(GO:0006813)、次生物质代谢(GO:0019748)、细胞生长(GO:0016049)、葡萄糖代谢(GO:0006006)、跨膜离子转运器活性(GO:0015075)、亚铁血红素结合体(GO:0020037)、氧化还原酶活性(GO:0016491)等方面基因显著上调,这与生理数据和表型数据一致。

关键词:杂草稻根系表达谱芯片耐旱

单位:黑龙江省农业科学院博士后科研工作站/黑龙江省农业科学院耕作栽培研究所/中国科学院北方粳稻分子育种联合研究中心; 哈尔滨155086; 沈阳农业大学水稻研究所; 沈阳110866; 辽宁省经济作物研究所; 辽宁辽阳111000; 中国水稻研究所; 杭州310006

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