摘要：【目的】为了明确南繁区稻瘟病菌(Magnaportheoryzae)的遗传分化情况，【方法】采用AFLP分子标记技术对南繁核心区(三亚、乐东和保亭)和非核心区(琼中、屯昌和定安)共60个稻瘟病菌菌株的遗传多样性和群体遗传结构进行了比较分析。【结果】聚类分析表明，几乎所有菌株都聚在同一个谱系里，并且该谱系没有明显的亚群；群体遗传结构分析表明，核心区群体的多态性位点百分率、Shannon信息指数和基因流分别为87.89%、0.2738和4.2897，高于非核心区群体的81.37%、0.2703和3.5892；然而，核心区群体的Nei基因多样性指数和基因分化系数分别为0.1657和0.1044，低于非核心区群体的0.1662和0.1223。【结论】这些结果表明核心区和非核心区菌株都存在丰富的遗传多样性，不同群体间均存在较多的基因交流，但遗传变异均主要来自群体内；相比之下，核心区菌株的遗传多样性和遗传分化程度较高。

关键词：南繁区 稻瘟病菌 遗传多样性 群体遗传结构 aflp 

单位：华南农业大学农学院广东省微生物信号与作物病害防控重点实验室; 广州510642