摘要：随着技术的发展及成本的降低，全基因组测序已经广泛应用于结核分枝杆菌的各方面研究当中，包括微进化与传播、宏观进化与种系发生、耐药检测等。根据现有研究成果，全基因组测序已经解决了很多传统分子研究方法无法解决的问题，比如鉴定传播链、分辨复发与再感染、解析结核分枝杆菌的进化过程、快速诊断结核病耐药、诊断混合感染等。尽管如此，目前还存在很多问题亟需解决。笔者对全基因组测序技术的研究方向及成果进行回顾，提出其局限性，并展望其应用前景。

关键词：分枝杆菌 结核 基因组 细菌 基因测定 

单位：复旦大学附属华山医院感染科; 上海200040